Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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