Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gp1bbP56400 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms