Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Opn1swP51491 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Opn1swP51491 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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