Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RorcP51450 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RorcP51450 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms