Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cxcl5P50228 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cxcl5P50228 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cxcl5P50228 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl5P50228 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl5P50228 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms