Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Srp9P49962 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Srp9P49962 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms