Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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