Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rab20P35295 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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