Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms