Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrbP28704 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms