Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxraP28700 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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RxraP28700 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxraP28700 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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