Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NapbP28663 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NapbP28663 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NapbP28663 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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