Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2afxP27661 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2afxP27661 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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