Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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