Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms