Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P10404 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P10404 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms