Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P01641 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
P01641 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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P01641 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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P01641 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P01641 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01641 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01641 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01641 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P01641 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P01641 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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