Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms