Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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