Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms