Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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