Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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