Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms