Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Zbed5B2RPU8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms