Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms