Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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