Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd1A2AKB4 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms