Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms