Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms