Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms