Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms