Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms