Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Wdr54Q9R0D8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Wdr54Q9R0D8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Wdr54Q9R0D8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Wdr54Q9R0D8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms