Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms