Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Higd1aQ9JLR9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms