Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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