Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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