Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms