Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms