Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms