Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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Hmg20aQ9DC33 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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