Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms