Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpn3Q9D3W4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms