Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pramef12Q9D2F1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Pramef12Q9D2F1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Pramef12Q9D2F1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Pramef12Q9D2F1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Pramef12Q9D2F1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms