Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Zbed3Q9D0L1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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