Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms