Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp5f1Q9CQQ7 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms