Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm21287-201ENSMUST00000191377 696 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 CT009721.1-201ENSMUST00000213590 770 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tspan6-201ENSMUST00000087557 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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