Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Chmp3Q9CQ10 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chmp3Q9CQ10 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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