Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrrtQ99MR6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrrtQ99MR6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrrtQ99MR6 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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